Vor dem Hintergrund ständig wechselnder Loyalität, unruhiger Allianzen und alter Feindseligkeiten, verschärft sich der Konflikt zwischen der Republik und den Separatisten - dieser legt letztendlich den Grundstein für Darth Sidious ultimativen Verrat an den Jedi. In diesen unsicheren Zeiten werden einige der tiefsten Geheimnisse der hellen und dunklen Seite der Macht aufgedeckt: Nicht nur, dass ein furchtloser Klon-Soldat eine schockierende Verschwörung aufdeckt, auch Anakin Skywalkers engste Beziehung kommt dadurch an ihre Grenzen. Und Meister Yoda macht eine Entdeckung, die das Gleichgewicht der Macht in der Galaxie für immer verändern kann...